Python怎么使用ClickHouse
ClickHouse是近年来备受关注的开源列式数据库(DBMS),主要用于数据联机分析(OLAP)领域,于2016年开源。目前国内社区火热,各个大厂纷纷跟进大规模使用。
今日头条,内部用ClickHouse来做用户行为分析,内部一共几千个ClickHouse节点,单集群最大1200节点,总数据量几十PB,日增原始数据300TB左右。
腾讯内部用ClickHouse做游戏数据分析,并且为之建立了一整套监控运维体系。
从2018年7月份开始试用,携程内部已经将80%的业务迁移到ClickHouse数据库上。每天数据增量十多亿,近百万次查询请求。
快手内部也在使用ClickHouse,存储总量大约10PB, 每天新增200TB, 90%查询小于3S。
在国外,Yandex内部有数百节点用于做用户点击行为分析,CloudFlare、Spotify等头部公司也在使用。
ClickHouse最初是为了开发YandexMetrica,这是世界第二大Web分析平台。多年来一直作为该系统的核心组件被该系统持续使用着。
1. 关于ClickHouse使用实践
首先,我们回顾一些基础概念:
OLTP
:是传统的关系型数据库,主要操作增删改查,强调事务一致性,比如银行系统、电商系统。OLAP
:是仓库型数据库,主要是读取数据,做复杂数据分析,侧重技术决策支持,提供直观简单的结果。
1.1. ClickHouse 应用于数据仓库场景
ClickHouse做为列式数据库,列式数据库更适合OLAP场景,OLAP场景的关键特征:
绝大多数是读请求
数据以相当大的批次(> 1000行)更新,而不是单行更新;或者根本没有更新。
已添加到数据库的数据不能修改。
对于读取,从数据库中提取相当多的行,但只提取列的一小部分。
宽表,即每个表包含着大量的列
查询相对较少(通常每台服务器每秒查询数百次或更少)
对于简单查询,允许延迟大约50毫秒
列中的数据相对较小:数字和短字符串(例如,每个URL 60个字节)
处理单个查询时需要高吞吐量(每台服务器每秒可达数十亿行)
事务不是必须的
对数据一致性要求低
每个查询有一个大表。除了他以外,其他的都很小。
查询结果明显小于源数据。换句话说,数据经过过滤或聚合,因此结果适合于单个服务器的RAM中
1.2. 客户端工具DBeaver
Clickhouse客户端工具为dbeaver,官网为https://dbeaver.io/。
dbeaver是免费和开源(GPL)为开发人员和数据库管理员通用数据库工具。[百度百科]
该项目的核心目标是提高易用性,因此我们专门设计和开发了一个数据库管理工具。免费、跨平台、基于开源框架和允许各种扩展写作(插件)。
它支持任何具有一个JDBC驱动程序数据库。
它可以处理任何的外部数据源。
通过操作界面菜单中“数据库”创建配置新连接,如下图所示,选择并下载ClickHouse驱动(默认不带驱动)。
DBeaver配置是基于Jdbc方式,一般默认URL和端口如下:
jdbc:clickhouse://192.168.17.61:8123
如下图所示。
在是用DBeaver连接Clickhouse做查询时,有时候会出现连接或查询超时的情况,这个时候可以在连接的参数中添加设置socket_timeout参数来解决问题。
jdbc:clickhouse://{host}:{port}[/{database}]?socket_timeout=600000
1.3. 大数据应用实践
环境简要说明:
硬件资源有限,仅有16G内存,交易数据为亿级。
本应用是某交易大数据,主要包括交易主表、相关客户信息、物料信息、历史价格、优惠及积分信息等,其中主交易表为自关联树状表结构。
为了分析客户交易行为,在有限资源的条件下,按日和交易点抽取、汇集交易明细为交易记录,如下图所示。
其中,在ClickHouse上,交易数据结构由60个列(字段)组成,截取部分如下所示:
针对频繁出现“would use 10.20 GiB , maximum: 9.31 GiB”等内存不足的情况,基于ClickHouse的SQL,编写了提取聚合数据集SQL语句,如下所示。
大约60s返回结果,如下所示:
2. Python使用ClickHouse实践
2.1. ClickHouse第三方Python驱动clickhouse_driver
ClickHouse没有提供官方Python接口驱动,常用第三方驱动接口为clickhouse_driver,可以使用pip方式安装,如下所示:
pip install clickhouse_driver Collecting clickhouse_driver Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/88/59/c570218bfca84bd0ece896c0f9ac0bf1e11543f3c01d8409f5e4f801f992/clickhouse_driver-0.2.1-cp36-cp36m-win_amd64.whl (173kB) 100% |████████████████████████████████| 174kB 27kB/s Collecting tzlocal<3.0 (from clickhouse_driver) Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/5d/94/d47b0fd5988e6b7059de05720a646a2930920fff247a826f61674d436ba4/tzlocal-2.1-py2.py3-none-any.whl Requirement already satisfied: pytz in d:\python\python36\lib\site-packages (from clickhouse_driver) (2020.4) Installing collected packages: tzlocal, clickhouse-driver Successfully installed clickhouse-driver-0.2.1 tzlocal-2.1
使用的client api不能用了,报错如下:
File "clickhouse_driver\varint.pyx", line 62, in clickhouse_driver.varint.read_varint
File "clickhouse_driver\bufferedreader.pyx", line 55, in clickhouse_driver.bufferedreader.BufferedReader.read_one
File "clickhouse_driver\bufferedreader.pyx", line 240, in clickhouse_driver.bufferedreader.BufferedSocketReader.read_into_buffer
EOFError: Unexpected EOF while reading bytes
Python驱动使用ClickHouse端口9000。
ClickHouse服务器和客户端之间的通信有两种协议:http(端口8123)和本机(端口9000)。DBeaver驱动配置使用jdbc驱动方式,端口为8123。
ClickHouse接口返回数据类型为元组,也可以返回Pandas的DataFrame,本文代码使用的为返回DataFrame。
collection = self.client.query_dataframe(self.query_sql)
2.2. 实践程序代码
由于我本机最初资源为8G内存(现扩到16G),以及实际可操作性,分批次取数据保存到多个文件中,每个文件大约为1G。
# -*- coding: utf-8 -*- ''' Created on 2021年3月1日 @author: xiaoyw ''' import pandas as pd import json import numpy as np import datetime from clickhouse_driver import Client #from clickhouse_driver import connect # 基于Clickhouse数据库基础数据对象类 class DB_Obj(object): ''' 192.168.17.61:9000 ebd_all_b04.card_tbl_trade_m_orc ''' def __init__(self, db_name): self.db_name = db_name host='192.168.17.61' #服务器地址 port ='9000' #'8123' #端口 user='***' #用户名 password='***' #密码 database=db_name #数据库 send_receive_timeout = 25 #超时时间 self.client = Client(host=host, port=port, database=database) #, send_receive_timeout=send_receive_timeout) #self.conn = connect(host=host, port=port, database=database) #, send_receive_timeout=send_receive_timeout) def setPriceTable(self,df): self.pricetable = df def get_trade(self,df_trade,filename): print('Trade join price!') df_trade = pd.merge(left=df_trade,right=self.pricetable[['occurday','DIM_DATE','END_DATE','V_0','V_92','V_95','ZDE_0','ZDE_92', 'ZDE_95']],how="left",on=['occurday']) df_trade.to_csv(filename,mode='a',encoding='utf-8',index=False) def get_datas(self,query_sql): n = 0 # 累计处理卡客户数据 k = 0 # 取每次DataFrame数据量 batch = 100000 #100000 # 分批次处理 i = 0 # 文件标题顺序累加 flag=True # 数据处理解释标志 filename = 'card_trade_all_{}.csv' while flag: self.query_sql = query_sql.format(n, n+batch) print('query started') collection = self.client.query_dataframe(self.query_sql) print('return query result') df_trade = collection #pd.DataFrame(collection) i=i+1 k = len(df_trade) if k > 0: self.get_trade(df_trade, filename.format(i)) n = n + batch if k == 0: flag=False print('Completed ' + str(k) + 'trade details!') print('Usercard count ' + str(n) ) return n # 价格变动数据集 class Price_Table(object): def __init__(self, cityname, startdate): self.cityname = cityname self.startdate = startdate self.filename = 'price20210531.csv' def get_price(self): df_price = pd.read_csv(self.filename) ...... self.price_table=self.price_table.append(data_dict, ignore_index=True) print('generate price table!') class CardTradeDB(object): def __init__(self,db_obj): self.db_obj = db_obj def insertDatasByCSV(self,filename): # 存在数据混合类型 df = pd.read_csv(filename,low_memory=False) # 获取交易记录 def getTradeDatasByID(self,ID_list=None): # 字符串过长,需要使用''' query_sql = '''select C.carduser_id,C.org_id,C.cardasn,C.occurday as ...... limit {},{}) group by C.carduser_id,C.org_id,C.cardasn,C.occurday order by C.carduser_id,C.occurday''' n = self.db_obj.get_datas(query_sql) return n if __name__ == '__main__': PTable = Price_Table('湖北','2015-12-01') PTable.get_price() db_obj = DB_Obj('ebd_all_b04') db_obj.setPriceTable(PTable.price_table) CTD = CardTradeDB(db_obj) df = CTD.getTradeDatasByID()
返回本地文件为:
3. 小结一下
ClickHouse运用于OLAP场景时,拥有出色的查询速度,但需要具备大内存支持。Python第三方clickhouse-driver 驱动基本满足数据处理需求,如果能返回Pandas DataFrame最好。
ClickHouse和Pandas聚合都是非常快的,ClickHouse聚合函数也较为丰富(例如文中anyLast(x)返回最后遇到的值),如果能通过SQL聚合的,还是在ClickHouse中完成比较理想,把更小的结果集反馈给Python进行机器学习。
操作ClickHouse删除指定数据
def info_del2(i): client = click_client(host='地址', port=端口, user='用户名', password='密码', database='数据库') sql_detail='alter table SS_GOODS_ORDER_ALL delete where order_id='+str(i)+';' try: client.execute(sql_detail) except Exception as e: print(e,'删除商品数据失败')
在进行数据删除的时候,python操作clickhou和mysql的方式不太一样,这里不能使用以往常用的%s然后添加数据的方式,必须完整的编辑一条语句,如同上面方法所写的一样,传进去的参数统一使用str类型
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